Շենգենյան գոտու 29 երկրներում սահմանային անցակետերում լուրջ խնդիրներ են առաջացել Եվրամիության նոր՝ Մուտքի-ելքի համակարգի (EES) գործարկման հետևանքով։ 2026 թվականի ապրիլից ամբողջությամբ ներդրված այս համակարգը, որը նախատեսված է անձնագրերի ձեռքով դրոշմակնքման փոխարեն թվային բիոմետրիկ գրանցում իրականացնելու համար, հանգեցրել է օդանավակայաններում հսկայական հերթերի և ուղևորների կողմից չվերթների բացթողման:
Նոր համակարգը պարտադիր է ԵՄ անդամ չհանդիսացող երկրների քաղաքացիների համար, ովքեր մուտք են գործում Շենգենյան գոտի՝ 180-օրյա ժամանակահատվածում մինչև 90 օր մնալու նպատակով: Գործընթացը ներառում է մատնահետքերի և դեմքի պատկերի թվային գրանցում: Թեև Եվրոպական հանձնաժողովը պնդում էր, որ յուրաքանչյուր ուղևորի գրանցումը կտևի ընդամենը մեկ րոպե, գործնականում՝ մասնավորապես Լիսաբոնի օդանավակայանում, ուղևորները հայտնում են ժամեր տևող սպասման մասին:
Սոցիալական ցանցերում տարածված բողոքները ցույց են տալիս, որ օդանավակայանների աշխատակազմը դժվարանում է կառավարել հոսքը: Չնայած ԵՄ պաշտոնական դիրքորոշմանը, որ համակարգը նպատակ ունի բարձրացնել անվտանգությունն ու արդյունավետությունը, ներկայիս իրավիճակը մտահոգություն է առաջացնում ամառային զբոսաշրջային սեզոնի ընթացքում ճամփորդողների շրջանում: Օդանավակայաններում առաջնահերթություն է տրվում միայն այն ուղևորներին, որոնք վայրկյաններ են հեռու իրենց չվերթի մեկնումից: